Cát Nhĩ Đan được Cách-lỗ phái của Phật giáo Tạng truyền nhận định là chuyển thế đời thứ ba của Ôn Tát Hoạt Phật (sư của Ban-thiền Lạt-ma thứ 4). Năm 1656, Cát Nhĩ Đan đến chùa Đại Chiêu ở Lạp Tát thuộc Tây Tạng, tiếp thu quán đình từ Đạt-lai Lạt-ma thứ 5. Sau đó, Cát Nhĩ Đan đến chùa Trát Thập Luân Bố ở Nhật Khách Tắc bái Ban-thiền Lạt-ma đời thứ 4 làm sư. Năm 1662, Ban-thiền Lạt-ma viên tịch, Cát Nhĩ Đan trở về chùa Đại Chiêu theo Đạt-lai Lạt-ma, rất được Đạt-lai coi trọng, trong thời gian đó ông đã kết làm hữu hảo với Tang Kết Gia Thác (桑結嘉错). Ngày 23 tháng 11 năm 1666, Cát Nhĩ Đan trở về Chuẩn Cát Nhĩ.

Ông đã ủng hộ anh trai Tăng Cách trở thành đại hãn của Chuẩn Cát Nhĩ, chống lại ý muốn của hai huynh đệ đồng phụ dị mẫu là Xa Thần (車臣, Tseten) và Trác Đặc Ba Ba Ba Đồ Nhĩ (卓特巴巴圖爾, Tsobda Batur). Với sự ủng hộ của Ngạc Tề Nhĩ Đồ Hãn (鄂齊爾圖汗) của Hòa Thạc Đặc hãn quốc, cuộc xung đột này đã kết thúc với phần thắng thuộc về Tăng Cách vào năm 1661. Tuy nhiên, hai người này đã mưu sát Tăng Cách vào năm 1671, khi Cát Nhĩ Đan hay tin, trong khi có thân phận Phật sống, ông đã hiệu triệu mọi người và ngay chóng tiến đến thung lũng sông Ngạch Nhĩ Tề Tư để trả thù cho cái chết của anh trai,[1] đánh bại Xa Thần bộ, đoạt lấy hãn vị của Chuẩn Cát Nhĩ. Năm 1671, Đạt-lai đã ban tước hồn thai cát cho Cát Nhĩ Đan. Năm 1672, Cát Nhĩ Đan tuyên bố hoàn tục, kế tục giữ chức thủ lĩnh Chuẩn Cát Nhĩ bộ, sai sứ sang triều cống nhà Thanh ở Trung Quốc, yêu cầu triều đình nhà Thanh thừa nhận quyền thống trị của bản thân.

Mặc dù đã kết hôn với A Nô khả đôn, cháu gái của Ngạc Tề Nhĩ Đồ hãn, Cát Nhĩ Đan vẫn tiến hành xung đột với Hòa Thạc Đặc hãn quốc. Lo sợ trước Cát Nhĩ Đan, Ngạc Tề Nhĩ Đồ hãn đã ủng hộ Sở Hổ Bố Ô Ba Thập (楚琥布烏巴什, Choqur Ubashi)- thúc phụ và cũng là kình địch của Cát Nhĩ Đan, là người đã từ chối công nhận hãn vị của Cát Nhĩ Đan. Chiến thắng trước Ngạc Tề Nhĩ Đồ hãn vào năm 1677 đã biến Cát Nhĩ Đan thành bá chủ Vệ Lạp Đặc Mông Cổ. Năm 1678, Cát nhĩ Đan được Đạt-lai Lạt-ma thứ 5 ban xưng hiệu "Bác Thạc Khắc Đồ Hãn" (博碩克圖汗, Boshoghtu Khan)[2], chính thức tuyên bố kiến lập Chuẩn Cát Nhĩ hãn quốc. Toàn bộ người Vệ Lạp Đặc Mông Cổ ở Dzungaria và tây bộ nước Mông Cổ ngày nay đã thống nhất dưới quyền của Cát Nhĩ Đan.